S/MARt DB - S/MAR

AC  SM0000061
XX
DT  1.1.1999 00:00:00 (created); ili
XX
NA  NT$H9
XX
OS  tobacco, Nicotiana tabacum
OC  eukaryota; viridiplantae; embryobionta; magnoliophyta;
OC  magnoliopsida; asteridae; solanes; solanaceae
XX
SZ  3619 bp
XX
LO  T3q, telomeric
XX
SQ  CCTAGGAGTATCACGGCTAATCTTTGGGCCTTTAGTTGGCAATTGTGGTCAATTATAAAT
SQ  TTAGGTGCCTCAGTCCTACGTATAATTTAATTTTAAATTTTTAATTTTAAATTCAACATC
SQ  AAGTAAGTAATAGCAATAATATTTTTAATGGAACATTGAAATTTTAATCAAAATTTTTTA
SQ  AATCGGCAACTTTTTTTAAAAAGGGATTAACGTTTTCTTATACGGGATCTTAAAACTTTT
SQ  TTAATAAATTATAAAAAATAGCATAATAAAATAATATAGAAAGCACATTAAAAATTTAAT
SQ  AAAATTAAAAAAGATTAAAGAAACTCATAGAAAAATAAAATATCTCGAATTCTTTTATTA
SQ  GTATAAATAACACAATAATGTTAAGTTTATTATTATAAATCAACTATAACGTTTGAACTT
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SQ  GTTACTAATTAGAAAATTTAACATATGATTTATGTAGTAACTCCCGAACACTAAGGATAG
SQ  GCATGTTCAGGATGCACAATTAGACATTTGGGGAGTAAGCCTCACACATGAGCCATCGCA
SQ  ACATGTGCCTCGCCCAGGAGTGAGTCATGGACGAGTCGAGAAAGACTTTTAKAGACATTA
SQ  ATCGACATCTTATATCAAATGTTATTTTTTTGCAACATGTAGTATCAATCGTTGTAGTTT
SQ  TCACAACATTTCTTCATAAATTTGACTGTTTTTACGATATTTCTTCATAAATGTTATTGT
SQ  TTTTACGATATTTAGTATCAAATGTCATTTTTTATAACATTTAATATCAAATGTCATTAT
SQ  TTTTATTACATTTTGTATCAAATGTCGTAATTTTGACGATATTTCTTCATTAATGTCGTT
SQ  ATTATTACGACATTTTGTATCAAATGTCATATTTTGATGACACTTAGTATCAAATGTCGT
SQ  AATGTTTGCGACACTTTGTATCAAATGTCGTAGTATTTACGACATTTATTCATAAATGAC
SQ  ATGAATTTCATATTTTTCTGAGATTTATTTCAAATGTCACTAAATAAATGTCGCCGTATC
SQ  CCTCACTTTCTTGGTAGTGGGTTGGACGGGAGGTCATGAATTTTGTACTACACTTTTGCA
SQ  TCTTGCATGCAAATGTTGGATGTTGATGTTGCTGTGATCGACGAGAGTTGGATTTGAAGA
SQ  CGTACCTGTATTCCGGTTGTAGCTGCATCTTGTTCATGGTAGCCTTAGATTTATAAAAAA
SQ  TCTGTTTATGTACTTTTCGAACAGATGATGTATTTTTTTTTATATTAGTTTTGTAAATTC
SQ  TAAATCTTAGAAGCTCATGATTTGTACTACCAATCCTTGAGAAATTTTTGTATAAAAACA
SQ  GTTTTATTATCATTTCTTTTCTTAATAAATCTCATTTAAATTGGATAGTTGTTAATTGAC
SQ  TTATCTGACGGGTTAAGTTATGTGCCATCACGACTAGGTGATTTTGGATCGTAACATTAA
SQ  TCATGAACTAACGGACTATATCCTAATATCCTTAAACATTAGGATAAGAGGTGAAAAAAG
SQ  ACACTTGAGAGCCTACCACAAAAATCTGGTACAATTAAATCCATCTCTGAATACCTAATA
SQ  CTATATAGTTATCCCAACACCATCCCCCGCTTGTTATAGAAATATATTGAAAATAAATCA
SQ  ATGGAGTTAACTCAAGCAAGATAATCTAATAAGAAATCTGAAAAAGTAGACAAGAGTTTG
SQ  AGGAAATTATCTTTAGGATAGTAATTTCCCCCACACGATGAAATGGTTAAAGGAAAATCT
SQ  ATCCCCAAAGATACAATGCCTACTCTAGAAATCAAAGTCGCACTCTTTGATTTCCCAACC
SQ  ACAAGAACTCAACTCGAAAGAATGAAGGGTTTGGAAGAAAGTATTACGAAGATTTGAGTA
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SQ  TTTAAGACTTCTGTAGAATACCCCTTTATATAGATAAAGTTTATGACCTTTGCCAATAGA
SQ  TGCTTCATTTAAATTTAAACAAACAGTTAACAAAGAGTTAGTTACTCATAGAAAAACACA
SQ  TCAGTTAGTTCCACAGAAGGCAACGGTTGAATTCAAATTTAAGATAGAATTCTTTTTCCT
SQ  GTTTTTTAAAATAAATATTATTATTAAATAATACATATATATTATTTTATATATAACACC
SQ  GCTATCTTTCCCTCTTTGGAACATTATTGCCAAGAACATGAAACTTTCTGCTGTCAGAGG
SQ  CGGACGTAGCCATATAGGTGCGGGTTCGGTCGAATTCAGTCATTTTTGTTTAAACATTAT
SQ  ATTTATACGAAGAAATTTATTAAATATGTACAAATATTTAATTGCGAACCCCGTAACTAA
SQ  GACGATCTATGGGTTCCGATGCAAATTCAGAACCCATAAACTTTAAATCCTGAATTCGTC
SQ  TCTGTCTACAGTCTCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATA
SQ  TATATATATATATACACACACGTAATGCTATACAACATAAGCTAGTATTTTAAGATTGTA
SQ  TTGCTTGTGAAAAGTCATACAGTTGATGCTGTTTGAACAGCTTCTATTTCATGCTTAACT
SQ  ATGATAGGCAAGTTTTACCTAGTGCACAGCCAAATGCACCCAAGGGATTGTCAACCGACG
SQ  TCCTTTTGTCAAAAAATTACACTATTTAGTTCGATAATATTTTAAAAAAAATATGTATAT
SQ  ATACTATATAATGGATACTTTTTTTGACTTCTTGGTGAGTTTATTTCTTCATATTTTGAC
SQ  TTACCTTAATGAAAATTTTGATTCGGCCACGAACTTTTACCTGCAATTATTTCAGTTCAT
SQ  CCATATCAATCAATGATGTGACAGATTTGTAAGAGTTAAGATAACGAGAAAGATCCAAAC
SQ  ATATATATGTCTCACACAACATGGAAAAGGCATTTTTTTGTGTGTCTAATATCAAACTCC
SQ  AACCTAACTTGCTAGGATCATTGACATTGTCACATGGCTTATCATTTTAGTTATCAGCTT
SQ  TTGATAATTGAAGAAACAACTTTCACTGGCGAGTGGTAACCCAAACACAATGCCAAGAGC
SQ  CAAGGGAAGAGACATCAGGATTCCGAAGAGACAGCATTAAGGGGTGAGTGCGAGTATACA
SQ  AGAGTCTGAAATGATATACTCTGCTATCTTTTCATGTCACTGGTTCTTTTTTGTTGTCAC
SQ  TACTCTTCGAGAAGCCTAG
SC  EMBL #Y12535
XX
FT  40 - 676(EMBL): AT-rich region that binds to tobacco nuclear
FT                  matrices in vitro [1]
FT  749 - 774(EMBL): AT-rich region [1]
FT  2836 - 2893(EMBL): AT-rich region [1]
FT  3163 - 3163(EMBL): T-DNA integration site [1]
XX
FF  identified in an analysis of sequences surrounding stably
FF  integrated T-DNA [1]
XX
EV  in vitro selection of S/MAR [1]
EC  tobacco matrix
XX
DR  EMBL: Y12535; NTDNAH9
XX
RN  [1]
RX  MEDLINE; 97432140 PubMed; 9286104
RA  Iglesias, V. A., Moscone, E. A., Papp, I., Neuhuber, F.,
RA  Michalowski, S., Phelan, T., Spiker, S., Matzke, M.,
RA  Matzke, A. J. M.
RT  Molecular and cytogenetic analyses of stably and unstably
RT  expressed transgene loci in tobacco
RL  Plant Cell 9:1251-1264 (1997)
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